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现代生物技术和近来有所突破的DNA序列分析引进了精度水平提高的作物育种技术，为动植物的转基因研究开辟了一个新的领域。而传统育种在有性繁殖的制约下，要随机转移数千个基因，所谓的“转基因”包括生物体之间特殊基因的鉴定、分离和转移，即使这些生物体不是性融合的。举例来说， Bt玉米当今的现代农业中最普遍的一种转基因作物，是从土壤细菌苏云金芽孢杆菌（Bacillus thuringiensis）获得的一种基因。
十几年前，转基因农业事实上是不存在的，但近十几年，无论是在种植总面积上，还是所涉及的国家的数目上，都开始迅速扩大（见图1）。2007年， 23个国家的农民种植的转基因作物超过了1.14亿公顷，种植的作物主要是大豆、玉米、棉花和油菜籽。而且，99％以上的转基因作物仅在美国、阿根廷、巴西、加拿大、印度、中国、巴拉圭、南非、乌拉圭和菲律宾等8个国家种植（见图2 ）。此外，广泛商业化的转基因作物目前表现的特性只有两个：耐除草剂性和/或抗虫性。这些转基因品种的许多专利属于像孟山都和先正达这样的重要生物科技公司。
目前，围绕转基因农业的争论是通过不确定性界定的。虽然实验室的研究和野外的研究还没有明确界定转基因农业对人类健康或环境的威胁，但现有的证据也不能够完全把它们对人类健康或环境的威胁排除在外。各国政府和国际组织已做出了响应，制定严格的框架指令控制以各种作物（crop-by-crop）为基础的转基因作物的试验、生产和销售。而围绕转基因农业制定的规章制度与传统农业的相比更为严厉，且存在一定的差距。一些组织，如“绿色和平”组织，继续倡导在全球转基因作物。
今天，反对转基因的抗议仍然盛行，并且对广泛利用转基因的规章制度的壁垒依然很高。在欧盟和日本，转基因作物的禁令将使人们保持对常规食物的需求增强。在未来，转基因和非转基因食品出口商之间经济竞争的加剧考虑到高昂的世界食品价格将会取代这些争议。在中国，随着其经济的迅速增长和人口极速膨胀，已经加大了在农业生物技术方面的投资，而且目前，一半以上的投资经费用于转基因作物，且所有的经费都由中国政府提供。将来，中国转基因农业利用的增长和日益增加的高质量科学研究的资助力度或许会消除一些不确定性。到那时，最实用的方式就是对每个转基因作物潜在的益处和风险进行一个有预防的、逐一的检验。
